W naszym liceum nie ma określonych profili, każdy uczeń ma dowolność wyboru trzech przedmiotów rozszerzonych. Pracujemy Metodą Monetssori. Podstawowym sposobem organizacji pracy w Liceum Montessori są krótkie prezentacje wprowadzające i praca własna, podczas której uczeń samodzielnie decyduje co i w jakiej kolejności będzie w danym dniu materią jego działania. Metodyka Montessori czyni ucznia współodpowiedzialnym za swoje wykształcenie, dając szerokie możliwości wyboru różnych ścieżek i sposobów realizacji programu. W tej metodzie uczeń ma czas na efektywną naukę połączoną z rozwijaniem pasji i zainteresowań. Każdy uczeń jest wspierany zarówno wychowawczo jak i dydaktycznie przez osobistego tutora oraz ma możliwości indywidualnych konsultacji z nauczycielami przedmiotowymi. Uczeń pracuje w swoim rytmie. Zamiast ocen i niezapowiedzianych kartkówek, dostaje rzetelny feedback.
Wśród rzeczy dodatkowych, a jednak niemniej ważnych, przykładamy wagę do tego, by rozwijać umiejętności medialne naszych uczniów (prasa, radio, scena), uwrażliwiać ich na bogactwo (kultura, nauka, turystyka), jakie daje Kraków, organizować różnego rodzaju wyprawy i podróże (poznanie świata, radzenie sobie w różnych sytuacjach). Ważnym założeniem naszej pracy jest dawanie przestrzeni na dobre relacje, zarówno między nauczycielami jak i uczniami, a także organizowanie różnych wydarzeń (np. Podróży, wyjazdów do pracy), wymagających wysiłku, nauki organizacji i wzajemnej komunikacji oraz wychodzenia ze strefy komfortu. Nieprzypadkowy jest przymiotnik „katolicki” w nazwie naszego liceum.